Календарь природы
Особую важность представляет ведение «Календаря природы». В нем отражен ход различных фенологических явлений по сезонам года. К основным из них у растений относят начало вегетации, цветение, созревание плодов, листопад и др. Для животных отмечают пробуждение и последнюю встречу перед зимним сном для видов с сезонной активностью (медведь, барсук, бурундук и другие); сроки прилета и отлета для птиц, улетающих в дальние края; даты появления детенышей у копытных — лося и кабана, сроки линьки и некоторые другие явления.
Рассматривая таблицу «Календаря природы», ясно видно, как с наступлением весны оживает природа, как богат и разнообразен ее мир, как постепенно, а потом все быстрее мелькают феноявления. Зимой же, все процессы замирают, все притихло, затаилось до наступления весны.
Изучению растительного покрова в заповеднике «Большая Кокшага» уделяется особое внимание. Ежегодно список растений уточняют, выявляют новые виды, фиксируют изменения ареала как типичных, так и редких, исчезающих растений.
На постоянных пробных площадях осуществляется мониторинг развития древесной и кустарниковой растительности. Проводится учёт подроста, подлеска, промеры диаметров и высот деревьев, учёт их санитарного состояния. Ведутся наблюдения за сукцессионными послепожарными процессами в различных типах леса.
Данные по количественной урожайности желудей являются интересными в связи с тем, что могут характеризовать динамику не только естественного возобновления дуба, но и численности животных, питающихся его плодами. На постоянных пробных площадях ведутся наблюдения за урожайностью черники и клюквы. Оценка плодоношения некоторых видов деревьев, кустарников, ягодников и грибов используется для анализа колебаний численности зверей и птиц. Например, численность белки в заповеднике, находится в прямой зависимости от урожая семян хвойных древесных пород на его территории.
Заповедник — территория, где животные обитают в естественной среде. Специалисты — зоологи круглый год проводят наблюдения за животными, строго следуя разработанным методикам. Так, в конце зимы, обязателен учет по следам на снегу, так называемым зимним маршрутным учётам (ЗМУ). Эта работа, вместе с весенними учетами бобров, летними учётами водоплавающих и боровых птиц, даёт ценную информацию о численности животных. Медведей, барсуков, енотовидных собак, пернатых хищников и других животных учитывают по специальным карточкам, которые исследователи заполняют на каждый случай встречи с ними. Собирается информация о местах их питания, размножения, гона, жилищах.